กระบวนการพิจารณาคดีศาลทหารไม่ต่างกับศาลพลเรือน

ตามพ.ร.บ.ธรรมนูญศาลทหาร พ.ศ.2498 กำหนดให้นำประมวลกฎหมายวิธีพิจารณาความอาญามาใช้พิจารณาคดีในศาลทหารด้วย จำเลยในศาลทหารมีสิทธิแต่งตั้งทนายความเข้าต่อสู้คดี และได้รับสิทธิตามประมวลกฎหมายวิธีพิจารณาความอาญาเช่นเดียวกับการพิจารณาในศาลพลเรือน แม้ภายใต้กฎอัยการศึกจำเลยจะไม่มีสิทธิอุทธรณ์ฎีกา แต่ปัจจุบันสิทธิอุทธรณ์ฎีกาก็กลับมาแล้ว จำเลยจึงไม่ได้ถูกละเมิดสิทธิในการพิจารณาคดีที่เป็นธรรมแต่อย่างใด